Nachdem du die Files ins Root Verzeichnis kopiert hast, musst du lediglich eine Zeile ändern.
In config/site.php steht eine Konstante DIR_REL welche auf das Unterverzeichnis zeigt, einfach diese Zeile entfernen und schon läuft concrete5 im Root Verzeichnis.
Falls du Pretty URLs aktiviert hast, dann würde ich die vorgängig deaktvieren und anschliessend wieder aktivieren, ansonsten musst du RewriteBase in .htaccess bearbeiten.
Als Vorsichtsmassnahme deaktiviere ich auch immer den Cache, könnte ja sein, dass dort irgendwo ein Pfad zwischengespeichert ist. Man sagt ja: Vorsicht ist die Mutter der Porzellankiste..